Села Иссык-кульской области, расположены в пяти районах. На северном берегу в Иссык-кульском, и Тюпском районе, на Южном побережье в Аксуйском Джеты-огузском, Тоонском, районах. Область включает в себя, пять поселков городского типа, и сто семьдесят пять сел, расположенных во всей котловине озера Иссык-куль.